مدیریت همکاری های علمی بین المللی دانشگاه خوارزمی با هدف تقویت علمی و اعتبار دانشگاه در عرصه بین المللی در سال ۱۳۸۱ تأسیس شده است. مأمویت اصلی این حوزه بین المللی سازی فعالیت ها و برنامه های دانشگاه ارتقا همکاری های بین المللی و استفاده از ظرفیت های موجود در دیگر کشورها است. مدیریت همکاری های علمی بین المللی در دانشگاه عهده دار تنظیم و پیگیری مناسبات بین المللی و برقراری ارتباط با سایر دانشگاه ها، مؤسسات و مراکز پژوهشی و نهادهای منطقه ای و بین المللی تخصصی، انجام امور مربوط به سفرهای علمی و رسمی خارجی اعضای هیأت علمی و نمایندگان دانشگاه، تهیه تفاهم نامه های همکاری های علمی پژوهشی با دانشگاه ها و مؤسسات آموزشی خارج از کشور و اقدامات لازم جهت دعوت از مهمانان خارجی، مشارکت در برگزاری کارگاه ها و دوره های آموزشی، سمینارها وکنفرانس های بین المللی و انجام امور مربوط به بورس ها و فرصت های مطالعاتی  می باشد. این دفتر به عنوان مدیریت مستقل تحت نظر ریاست دانشگاه فعالیت می کند.